miRNA Universal SYBR qPCR Mix 熒光定量
2x miRNA Universal SYBR qPCR Mix(莖環(huán)法)是專門為莖環(huán)法miRNA定量檢測(cè)而研發(fā)的新一代預(yù)混形式的熒光定量PCR檢測(cè)試劑,其中的DNA polymerase 采用的是抗體修飾的熱啟動(dòng)形式, 配合特殊的Buffer 體系,使反應(yīng)特異性更好,靈敏度更高,并能在更廣的范圍內(nèi)進(jìn)行準(zhǔn)確定量。miRNA Universal SYBR qPCR Mix 熒光定量
2x miRNAUniversal SYBR qPCR Mix (莖環(huán)法)
miRNA Universal SYBR qPCR Mix 熒光定量
目錄號(hào):71501
產(chǎn)品內(nèi)容
Components | 71501-500 500 rxns(20 μl/rxn) | 71501-2500 2500 rxns(20 μl/rxn) |
2x miRNA Universal SYBRqPCR Mix | 1 ml x5 | 1 ml x25 |
保存條件
-20℃保存,有效期 24 個(gè)月。
使用前,充分融解,輕輕顛倒混勻,短期使用可放在 4 ℃,避免反復(fù)凍融。
產(chǎn)品簡介
2x miRNA Universal SYBR qPCR Mix(莖環(huán)法)是專門為莖環(huán)法miRNA定量檢測(cè)而研發(fā)的新一代預(yù)混形式的熒光定量PCR檢測(cè)試劑,其中的DNA polymerase 采用的是抗體修飾的熱啟動(dòng)形式,配合特殊的Buffer體系,使反應(yīng)特異性更好,靈敏度更高,并能在更廣的范圍內(nèi)進(jìn)行準(zhǔn)確定量。
預(yù)混液中含有通用型ROX,適用于所有qPCR儀,使用qPCR Mix時(shí)不需要額外添加ROX來校正儀器。
需要自備的試劑:
待檢測(cè)miRNA對(duì)應(yīng)的qPCR的引物
Realtime 上游引物設(shè)計(jì):
miRNA序列除去3’端6個(gè)堿基 的剩余部分作為上游引物,如miR-1的上游引物為(注意 把U改為T):TGGAATGTAAAGAAGT.檢查引物的Tm 值(一般參考DNAMAN),如果Tm值較低,則在5’端加GC使Tm值接近60度。因此miR-1的上游引物可設(shè)計(jì) 為:GCGCTGGAATGTAAAGAAGT,61.4度。
下游引物是通用的,序列為GTGCAGGGTCCGAGGT。
引物設(shè)計(jì)好后,需要通過預(yù)試驗(yàn)檢測(cè)引物的特異性。一般需要做溶解曲線來檢測(cè)引物的特異性;同時(shí)最好將PCR產(chǎn)物進(jìn)行電泳檢測(cè)產(chǎn)物是否單一(產(chǎn)物長度很短,需要3%以上的瓊脂糖膠)
操作步驟:
1. 在室溫融化2x miRNA qPCR Mix、primer(10μM)、DNA模板、ddH2O,并置于冰上備用。
2. 冰上配制qPCR反應(yīng)體系:(以20μl反應(yīng)體系為例)
Components | Volume (20μl) | Final Concentration |
2x miRNA Universal SYBR qPCR Mix | 10 μl | 1× |
DNA Template | Variable | As required |
Forward Primer (10μM) | 0.4 μl | 0.2 μM each |
Reverse Primer (10μM) | 0.4 μl | 0.2 μM each |
ddH2O | Up to 20 μl | Not applicable |
1) 推薦模板加樣量為1-2μl / 20μl反應(yīng)體系,cDNA原液≤總反應(yīng)體系的10%。
2) 對(duì)于特殊的檢測(cè)體系中,高含量的cDNA 模板易導(dǎo)致非特異性擴(kuò)增,根據(jù)所檢測(cè)miRNA的豐度適當(dāng)?shù)南♂宑DNA(10倍或者100倍)。
3) 通常推薦引物濃度為0.2 μM,就可以得到較好的結(jié)果,反應(yīng)效果不佳時(shí)可在0.1 - 1.0 μM范圍內(nèi)進(jìn)行調(diào)整。
擴(kuò)增效率不高的情況下,可提高引物濃度;發(fā)生非特異性反應(yīng)時(shí),可降低引物濃度,由此優(yōu)化反應(yīng)體系。
3. qPCR反應(yīng)程序
注意:
1) 本產(chǎn)品兼容性強(qiáng),絕大多數(shù)情況下使用二步法和三步法均可獲得良好效果。一般來說,二步法擴(kuò)增特異性高,三步法擴(kuò)增效率高。如果融鏈曲線較差,可以嘗試兩步法擴(kuò)增或提高退火溫度;如果因使用Tm值較低的引物等原因,得不到良好的實(shí)驗(yàn)結(jié)果時(shí),可嘗試加長延伸時(shí)間或者進(jìn)行三步法PCR擴(kuò)增。
2) 根據(jù)引物的Tm值進(jìn)行退火&延伸(退火)溫度的設(shè)定;
3) 延伸(退火&延伸)時(shí)間的設(shè)置還需要根據(jù)您所使用的qPCR儀所需要的最短數(shù)據(jù)采集時(shí)間自行調(diào)整。
4) 融解曲線分析請(qǐng)以所使用的熒光定量PCR儀推薦的程序進(jìn)行設(shè)定。
miRNA Universal SYBR qPCR Mix 熒光定量